[박종화의 게놈 이야기(최종회)] 게놈 이야기의 미래

2024.06.18

내 아내는 조지 처치의 아내인 Ting Wu(팅 우) 박사를 GET(겟) 학회에서 처음으로 만났다. 팅 우 박사는 하바드 의대 교수이고 게놈 관련 교육에 관심이 많았다. 조지의 딸도 게놈 해독이 됐는데 공개는 하지 않았다. 매년 열리는 GET conference 중에서...

[박종화의 게놈 이야기(54)] 임산부 DNA와 태아 DNA

2024.06.04

칼럼스티브 퀘이크 박사는 게놈 분야에 업적을 남긴 사람이다. 힐리코스사는 임산부의 핏속에 있는 태아의 DNA를 진단하는 기법을 해독기를 이용해 만들려고 했고 스티브 퀘이크 박사는 회사를 2개나 상장시킨 사람이다. 데이스 로라는 중국인 학생이 옥스퍼드대에서 최초로 임산부...

[박종화의 게놈 이야기(53)] 게놈 미래

2024.05.28

나는 20년 뒤에 ‘노화 이야기’라는 책을 쓸 계획이다. 그때는 이미 게놈학이 생명체의 근본 기작 해명에 큰 기여를 했기 때문에 선진국의 인간 수명이 평균 100세가 됐고 노화를 방지하는 방법들이 나오기 시작했을 것이다. 수억 년 동안의 진화를 통한 내 몸속의 게놈이...

[박종화의 게놈이야기(52)] 게놈 혁명

2024.05.21

2008년 10월 17일에는 기다리던 최초의 중국인 게놈 데이터가 공개됐다. 중국인 게놈도 이미 BGI(Beijing Genomics Institute) 회사에서 몇 년 전에 그것을 한다는 보도 자료를 내고 추진됐었다. 최종 논문은 ‘최초의 아시아인 게놈’이라는 제목으...

[박종화의 게놈이야기(51)] 개인 게놈 분석 이후의 생정보학 분석

2024.05.07

기초적인 게놈 지도화와 변이에 대한 분석이 끝나면, 그 이후 수없이 많은 다양한 생명정보 분석이 가능하다. 예를 들면 단백질에 변이가 있는지, 질병과의 연관도를 다각도로 계산해 내던가, 각종 약물에 이 유전체의 소유자가 어떤 체질적 특성을 가지는지, 면역학상 어떤 특이...

[박종화의 게놈이야기(50)] 전체 서열의 정확도와 완전해독

2024.04.30

해독이 끝난 유전체의 정확도를 산정하는 표준화된 방법이 당시엔 없었다. 또한 유전체를 진짜로 완전히 해독한다는 것도 당시로선 불가능했고, 미국에서도 앞으로 몇 년 혹은 몇십 년이 걸릴 수도 있다. 유전체의 정확도는 다양한 지표(parameter)와 사용한 기계의 방법,...

[박종화의 게놈이야기(49)] 개인유전체 분석 과정

2024.04.22

미국의 표준게놈 서열에 한국인(SJK)을 비교 해본 결과 표준게놈 대비 99.90%에 부합됐다. 서양인 표준게놈과 비교 분석 시, 정확성을 높이기 위해 36 또는 75bp 염기 길이의 서열 조각이 이미 알려진 표준게놈의 영역에 정렬을 할 때 36개 또는 75개 염기 중...

[박종화의 게놈이야기(48)] 한국인 게놈 논문 내용

2024.04.09

김성진 박사의 한국인 게놈 프로젝트에서 해독한 DNA 조각 수는 무려 17억5,000만개였다. 총 합산된 DNA 길이로는 821억 염기(base pair)에 해당된다. 이 양은 한 개인 유전체 총량의 29배에 해당하며, 현재 널리 쓰이는 컴퓨터 하드디스크에 저장된 형태...

[박종화의 게놈이야기(47)] 게놈에 대한 몇 가지 개념 이야기

2024.04.02

# 선도게놈해독과 재해독 (Resequencing) 차이 한 생물의 전장(full length) 게놈을 해독(sequencing)하는 것은 대체로 두 가지로 나눈다. 하나는 선도 해독 혹은 신생 해독 (de novo sequencing)이다. 생어해독기를 사용하며, 게...

[박종화의 게놈이야기(46)] 한국인 게놈 분석의 의미

2024.03.26

두개의 한국인 게놈이 2009년 5월과 7월에 발표 된 것은 2008년 11월 중국의 BGI사가 논문을 발표한지 6개월만의 일이었다. 2010년 10월에 발표된 일본인 게놈보다는 1년 5개월이 앞선 것이다. 게놈 해독에 경쟁이 붙다보니 계속 첫 번째니 두 번째니 하는...