박 종화 | UNIST News Center

[박종화의 게놈이야기(34)] 국가유전체정보센터

생물자원부터 정보처리까지…통합 관리 중요 K-바이오 컨트롤타워 역할 강화 ‘코빅’ 설립

‘게놈 프로젝트’ 등 성과…빅데이터 기반 마련

2005년 3월부터, 카이스트에서 국가유전체정보센터장으로 이직했다. 한국에 온 이후로 다시 한번 커다랗고 행복한 기대를 하게 됐다. NGIC는 국가에서 지원하는 센터로, 게놈 정보를 전문적으로 수집, 연구, 유통하는 곳이었다. 이곳은 전임 센터장인 김상수 박사에 의해 운영되고 있었고, 적당한 자극과 기술... 더보기

2023.11.21By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기(33)] 게놈전문회사들

2000년대초 전세계 게놈 사업화 ‘찬바람’ 상품화 실패·고비용·특허 불가…거품 입증

생정보학 기술 활용 의료시장은 성장 가속

마크로젠이란 회사가 한국에 있는데 서울대의대 서정선 교수가 설립한 회사였다. 1997년에 게놈 관련 사업을 추구하면서 설립이 됐는데 주로 생어방식의 서열해독을 해주는 회사였던 것으로 안다. 초기에 생정보학 연구자를 10여명 영입했으나 나중에 그 부서의 크기가 줄었다. 그 회사의 초기 사장 중에 박현석 박... 더보기

2023.11.15By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기(32)] 카이스트 바이오시스템학과

분자수준 · 질병 등 포괄 광범위한 ‘바이오’ 아직도 인간 게놈속 유전자수 정확히 몰라

지금 컴퓨터 이용하듯 활용하는 시대 돼야

2003년 바이오시스템학과는 그 이름만 보면, 게놈에서 트랜스크립톰(전사체), 프로티옴(단백체)를 통해 세포와 생물이 어떻게 네트워크를 이용해 복잡한 조절작용을 하는가를 연구하는 것을 목적으로 세워진 과이다. 설사 그 당시의 교수들이 바이오시스템을 얼마나 이해했는지는 다른 질문이지만 어쨌거나 그런 것을... 더보기

2023.11.07By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기 (31)] 최초의 박테리아 게놈 – 히모필러스 인플루엔지

독립 생명현상 유지 히모필러스 인플루엔지 고등진핵생물과 달리 인트론 적은 효모게놈

수학적으로 최적화돼 적은 양으로 평행이뤄

[박종화의 게놈이야기 (31)] 최초의 박테리아 게놈 – 히모필러스 인플루엔지

히모필러스 인플루엔지는 이름에서도 알 수 있듯이, 감기를 일으키는 세균(박테리아)이다. 이것의 완전한 게놈서열이 1995년 ‘사이언스’ 학술지에 발표됐다. 크레이그 벤터가 마지막 저자로 돼있다. 생물학에선 일반적으로 마지막 저자가 그 프로젝트를 이끈 사람이나 그룹의 대표자이다. 이 게놈의 크기는 1,83... 더보기

2023.10.31By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기(30)] 차세대 해독기 등장

물리 · 화학 · 생물 등의 결합물 ‘차세대 해독기’

가장 발전된 전기신호 사용법 ‘아이언 토런트’ 반도체 칩에 DNA 합성효소로 수소이온 감지

차세대 해독기는 2000년대 초부터 등장한 것이다. 그러나 그 실질적인 기술은 이미 1990년대 말에 완성돼있었다. 단지 이런 기술들을 통합해, 하나의 파이프라인이나 장치로 못 만들었을 뿐이다. 내가 1998년 1월 1일부터 하바드의대의 조지 처치 랩에서 일했을 때, 조지는 병렬화된 로봇트로 DNA해독기... 더보기

2023.10.24By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기(29)] 초기 게놈해독역사

1970년대 유전자 · RNA 게놈서열 최초 해독 생어 ‘사슬막기방법’ 수십년간 표준으로 자리

현재 ‘산탄총 해독법’ 다량의 DNA 처리 가능

생어 이전에도 염기서열을 해독한 사람들이 있다. 염기서열 해독은 RNA의 해독에서 먼저 시작됐다. 벨기에의 월터 피어스가 겐트대학에서 1972년 최초의 유전자 서열과 최초의 RNA 게놈 서열(1976)을 해독해 냈다. 그 뒤 미국 하버드대학의 막삼과 길버트가 1973년 24개의 염기를 해독해 냈으나, 제... 더보기

2023.10.17By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기(28)] 인간 게놈 프로젝트 완료

세계 최대 규모 게놈학문 주도 생어연구소 MRC센터와 인간게놈 프로젝트에 큰 역할

DNA 해독법 가운데 사슬막기방법 만들어

1990년대 말, 생어연구소는 세계에서 가장 큰 게놈연구소로서 세계 게놈학문을 주도하고 있었다. 100대가 넘는 생어식 DNA해독기를 설치하고, 당시에는 상상하기 어려운 엄청난 양의 컴퓨터 저장장치를 확보하고 있었다. 내 친구 알렉스 베이트만이 그 시설을 보여줘 내부를 볼 수 있었다. 또, 당시에 계속해... 더보기

2023.10.10By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기(27)] 케임브리지의 생어 게놈 캠퍼스

EBI서 연구중 MRC센터 그룹리더 지원 연구실 등 인프라 한계로 카이스트 이동

한국 IT 활용 생정보학 신산업 만들고파

생어연구소는 내가 박사학위를 할 때 설립 됐다. 내 지도교수 팀 허버드는 1996년 MRC센터에서 생어연구소의 그룹리더로 이직을 했다. 케임브리지의 생정보학 관련 많은 사람들이 그 당시에 생어연구소와 EBI등으로 옮기고 있었다. 왜냐하면 생어연구소는 게놈관련 전문 연구소였고, EBI는 게놈같은 대형 데이... 더보기

2023.09.27By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기(26)] 하버드 의대 유전학과-생물학 연구의 천국

조지 처치랩, 하버드서 게놈 · 바이오칩 연구 효모 칩 실험 통해 DNA서열 해독기술 알게돼

값진 경험안고 1999년 케임브리지로 돌아가

조지 처치랩은 하버드에서 가장 친근한(Friendly) 랩이라고 소문이 나있었고, 가장 가고 싶은 랩이라는 것이 그 당시 학생들 사이의 의견이었다. 하버드에서 거의 독보적으로 생정보학을 하고, 게놈 연구와 바이오칩을 하는 곳이었다. 내가 갔을 당시에 처치랩은 하버드 의대의 본대학 건물에 있었다. 하버드... 더보기

2023.09.22By 박 종화기고, 피플

[박종화의 게놈이야기(25)] 게놈은 생명현상 본질을 보여주는 아름다운 창문

게놈학, 생물학의 핵심 … 과학과 철학의 정보 제공

1997년 박사학위 취득후 MRC센터서 포닥 시작 이후 ‘기능유전체학’ 연구에 관심 가야할 길 정해

[박종화의 게놈이야기(25)] 게놈은 생명현상 본질을 보여주는 아름다운 창문

박사 3년을 마치는 동안에도 생정보학 (Bioinformatics)이라는 말을 쓰는 사람이 별로 없었다. 그래서 생정보학을 한다고 하면 같은 연구소사람 또는 케임브리지대 친구들을 비롯해 내가 아는 대부분의 사람들이 그것이 무엇이냐고 되물었다. 나는 설명을 해주면서 종종 생정보학이 생물학에서 가장 중요한... 더보기

2023.09.13By 박 종화기고, 피플

Writer|박 종화 |바이오메디컬공학과

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