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Home 박종화

[박종화의 게놈 이야기(최종회)] 게놈 이야기의 미래

게놈학, 생명체 진화의 역동적 발전 엔진

암 치료는 물론 정신 건강까지 의료 혁신, 게놈산업육성법 제정 등 정부 지원 절실

[박종화의 게놈 이야기(최종회)] 게놈 이야기의 미래

내 아내는 조지 처치의 아내인 Ting Wu(팅 우) 박사를 GET(겟) 학회에서 처음으로 만났다. 팅 우 박사는 하바드 의대 교수이고 게놈 관련 교육에 관심이 많았다. 조지의 딸도 게놈 해독이 됐는데 공개는 하지 않았다. 매년 열리는 GET conference 중에서 특히 2010년이 의미가 있었던 이... 더보기

2024.06.18By 박 종화기고
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[박종화의 게놈 이야기(53)] 게놈 미래

게놈학 진일보…영원한 청춘 항노화시대 기대

생명존중 문화 확산 개개인 삶의 기준 전환도

[박종화의 게놈 이야기(53)] 게놈 미래

나는 20년 뒤에 ‘노화 이야기’라는 책을 쓸 계획이다. 그때는 이미 게놈학이 생명체의 근본 기작 해명에 큰 기여를 했기 때문에 선진국의 인간 수명이 평균 100세가 됐고 노화를 방지하는 방법들이 나오기 시작했을 것이다. 수억 년 동안의 진화를 통한 내 몸속의 게놈이 스스로의 서열을 해독하게 했고 그 게... 더보기

2024.05.28By 박 종화기고
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[박종화의 게놈이야기(49)] 개인유전체 분석 과정

세포 내 DNA 염기서열 분석 게놈지도 완성

서열해독기 등 기술 성장 ‘바이오산업’ 기대

[박종화의 게놈이야기(49)] 개인유전체 분석 과정

미국의 표준게놈 서열에 한국인(SJK)을 비교 해본 결과 표준게놈 대비 99.90%에 부합됐다. 서양인 표준게놈과 비교 분석 시, 정확성을 높이기 위해 36 또는 75bp 염기 길이의 서열 조각이 이미 알려진 표준게놈의 영역에 정렬을 할 때 36개 또는 75개 염기 중 염기의 불일치 숫자가 2개 이하 인... 더보기

2024.04.22By 박 종화기고
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[박종화의 게놈이야기(21)]1995년 최초 박테리아 게놈 3개 공개되다

1995년 공개된 박테리아 게놈 3개 ‘큰 관심’

MG게놈 유전자 추출해 숫자 · 내부 등 비교 진화 연구 등 근원적 유전자 연구 매우 용이

[박종화의 게놈이야기(21)]1995년 최초 박테리아 게놈 3개 공개되다

1990년대 초까지는 생정보학에서는 3차원 구조와 단백질 서열연구가 가장 주된 분야였다. 사람들은 게놈이나 DNA서열보다는 기능을 하는 단백질에 더 많은 연구를 했다. 그래야 제약회사에서 돈도 나오고, 또, 논문내기도 쉬웠다. 또 다른 것은 DNA서열 해독이 그때까지도 비싸고 힘들었다. 내가 팀에게서 이... 더보기

2023.08.16By 박 종화기고, 피플
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[박종화의 게놈이야기 19] 캘리포니아 아실로마

1994년 팀 허버드에게서 받은 선물 Ind5 일종의 개인용 수퍼컴퓨터로 작업에 큰 도움

대용량 전산인프라로 게놈 제대로 연구해봐

[박종화의 게놈이야기 19] 캘리포니아 아실로마

몇 달 뒤에 대회의 결과를 발표하는 학회가 캘리포니아의 서부 몬터레이 근처 아실로마에서 있었다. 그런데, 가보니, 팀 허버드와 내가 가장 많이, 가장 정확하게 3차원 구조 인식 예측을 했다. 그래서 1차 CASP대회에서 3가지 세부 분야 중 한군데에서 MRC 센터 팀이 우승을 했다고, 내부에서 소문이 돌... 더보기

2023.08.01By 박 종화기고, 피플
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[박종화의 게놈이야기-18] 팰린드롬과 프랙탈

팰린드롬 연구 ‘게놈 = 프랙탈’ 3차원 구조 대칭 추측

MRC센터 팀하버드 소개 Perl 프로그래밍 언어 배워 서열정렬 알고리즘 활용 단백질구조 프로그램만들어

[박종화의 게놈이야기-18] 팰린드롬과 프랙탈

나는 팰린드롬(Palindrome)도 연구를 했었는데, 그것은 RNA나 DNA 바이러스의 게놈은 대칭적인 3차원 구조를 가지고 있을 거라는 추측에 의해서였다. 게놈도 하나의 거대한 분자로, 평형을 이뤄져야 하기 때문에, 3차원구조도 대칭적일 것이라고 추측했다. 이것을 바탕으로 나는 게놈은 프랙탈(Frac... 더보기

2023.07.18By 박 종화기고, 피플
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[박종화의 게놈이야기 16] 크릭과 왓슨과 DNA모델

생명의 역사를 쓸 때, DNA문자를 쓴다

생정보학 중요한 부분을 차지해

[박종화의 게놈이야기 16] 크릭과 왓슨과 DNA모델

생명의 역사를 쓸 때, DNA문자를 쓴다. 1953년 케임브리지의 크릭과 왓슨이 로잘린 프랭클린과 모리스 윌킨스의 엑스레이 결과를 도용해 이미 알려져 있던 2중 나선 식의 DNA모델을 제시한다. 크릭은 2중 나선 구조에서 가장 중요하게 생각한 것이, DNA의 정보가 서로 짝을 이루면서 저장되어 있고, 반... 더보기

2023.07.04By 박 종화기고, 피플
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[박종화의 게놈 이야기 (14)] 서열이란 무엇인가?

‘서열’ 없을 시 생명체 정보 처리는 불가능 어떤식으로든 바뀌면 생명현상 변이 발생

모든 유전자 조상가져 유전학은 족보연구

[박종화의 게놈 이야기 (14)] 서열이란 무엇인가?

서열의 일반적 정의는 ‘순서’를 가진 문자의 나열이다. 서열 (sequence)은 생명현상에서 가장 중요하다. 순서가 없으면 서열이 아니고, 서열이 없으면 우리가 아는 지구상의 생명체의 정보처리는 불가능하다. 막스 퍼룻쯔 박사는 단백질의 서열과 구조를 연구하면서 단백질의 서열에 1차 구조(Primary... 더보기

2023.05.30By 박 종화기고, 피플
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[박종화의 게놈 이야기 (13)] 게놈과 언어

게놈, 수많은 염기서열로 이뤄진 생명체 단순 저장 정보 아닌 ‘컴퓨터 CPU’ 역할

물 · 단백질과 상호작용하는 언어적 기계

[박종화의 게놈 이야기 (13)] 게놈과 언어

게놈은 물리적인 우주, 지구, 세포, 생물, 생태계를 수학적으로 반영한 일종의 암호이고, 언어이다. 이 언어는 3차원 구조의 완벽한 에너지 평형을 이루는 동시에 정보를 저장하고 있다. 그래서 게놈의 구조는 레고 같은 단순한 블럭이 모여서 이어진 것이 아니라, 3차원, 4차원, 다차원으로 이리 저리 접히고... 더보기

2023.05.23By 박 종화기고, 피플
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[박종화의 게놈이야기 (12)]슬픈 학부 졸업

학과장 기습 질문에 자기주도 답변으로 인정 4학년 나홀로 1등급 … 절대평가 문제점 느껴

학문, 직업의 도구로만 인식돼 마음 안좋기도

[박종화의 게놈이야기 (12)]슬픈 학부 졸업

학과장인 이언 부스 교수가 무슨 꿍꿍이인지 자기도 내게 질문을 하나 했다. 대답을 잘해서인지 아니면 자기 생각에 자기 학과 학생이 답을 제대로 못한다고 생각했는지는 모르겠다. 자신의 수업시간에 가르쳤던 생화학 문제였다. 단백질이 하나의 조그만 분자 스위치 역할을 하는데 20개의 아미노산 중에서 어떤 것이... 더보기

2023.05.01By 박 종화기고, 피플
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